病死畜禽是畜牧业生产中一定遇到的产物，其处理方式受畜禽死亡率和养殖模式影响。
1.散养
20世纪70年代以前，我国的养殖业基本上处于农村散养状态，那时的养殖总量小，死亡率低，即使出现死亡，数量不大，通过深埋等简易方式就可以处理掉。当前的畜牧业已经发展到了一个新阶段，动物的存栏量、出栏量都有了成十几倍的增长。以2012年的生猪为例，全国年末存栏量达到47 492万头，出栏69 628万头，按照10%的死亡率计算，每年约7 000万头畜禽死亡。养殖模式也由单纯的散养转变为散养、作坊式养殖、小型规模化养殖和大型企业化养殖等多种养殖模式共存的局面。简单的深埋方式已经不能满足病死畜禽处理的需要。
三种饲养模式中，散养畜禽量占的比例很小，即使发病死亡，数量不多，容易处理，通过简易的深埋、焚烧等方式就可以处理掉。以山东东营垦利县的家禽养殖为例，全县存栏家禽90万羽，散养家禽不足1万羽，所占比例不足1%。散养生猪、牛、羊的比例也不足3%。散养方式对畜禽死亡量的影响很小。大型企业化养殖的数量在畜牧业总量中占有一定的比例，但它们的管理能力较强，从业人员的技术水平较高，畜禽死亡率低，死亡数量也不会太多，而且它们具有一定的经济实力，具备购置无害化处理设施的能力，病死畜禽无害化处理基本不是问题。
2.作坊式养殖或小型规模化养殖
（1）它们设施简陋，技术专业水平较低，管理粗放，是病死畜禽的主要来源。以养猪场为例，它们的饲养规模多在100～1 000头左右，猪舍简易、以夫妻养殖或雇用民工为主要人员，缺少技术人员，管理粗放，猪场很容易发病。浙江嘉兴地区的生猪养殖基本是这种模式，一旦发病，大面积传播，会在短时间产生大量的病死畜禽。简易的深埋方式已经不能承受大量畜禽死亡处理的要求，这些养殖户没有实力购买新型的无害化处理设施。他们处理病死畜禽的方式就是丢弃或卖掉，既简便又省力。这是他们的特点之一。
（2）养殖场畜禽发病呈周期性发生，每年冬春或秋冬交接、或夏季雨后是畜禽的死亡高峰期。在时间表上，病死畜禽数量呈现出忽高忽低的形势，很难利用新型无害化处理设施开展持续性作业，往往造成设备的闲置和浪费。
（3）作坊式、小型规模养殖场在地域上分布分散，病死畜禽的收集会产生大量成本，这无疑给无害化处理造成障碍。
