传染性疾病目前仍然是制约我国养禽业快速发展的主要因素之一，而免疫接种仍然是预防传染性疾病的有效手段，要达到这一目的，最为重要的一个环节就是合理地制定免疫程序。
1、目前各饲养场（户）制定免疫程序时存在的主要问题
（1）偏离本场的实际情况，生搬硬套别人的免疫程序，针对性差。
（2）缺乏科学根据，不符合免疫学的基本理论。
（3）一个免疫程序实施一段时间后，疫情的流行特点或疫苗的使用种类都发生了变化，免疫程序修订和调整滞后。
2、制定免疫程序的依据 制定合理的免疫程序是正确使用疫苗的关键环节，在制定免疫程序时除了依据本场实际情况以及参考别人的成功经验之外，还应着重考虑以下因素：
（1）本地区禽病疫情：免疫的疫病种类应包括可能在本地爆发及流行的主要疫病，如刚流行过的疫病或正在附近鸡场流行的疫病等。对于我国养禽业来说，重要的家禽传染病如鸡马立克氏病、鸡新城疫、鸡传染性法氏囊病、鸡传染性支气管炎、鸡传染性喉气管炎、鸡产蛋下降综合征等在我国大部分的地区广为流行，且难以及时治愈，因此应将以上疾病的免疫纳入免疫程序中。
（2）依据本场的禽病史以及目前仍威胁本场的主要传染病制定重要防控疾病免疫程序。
（3）因所养家禽的用途及饲养时期不同，接种疫苗的种类各有侧重。
（4）母源抗体水平的影响。这一点在选择鸡马立克氏病、鸡新城疫和鸡传染性法氏囊病活疫苗时应认真考虑。
（5）不同种类的家禽对某些疾病抵抗力的差异：如肉用种鸡对病毒性关节炎的易感性要比蛋用鸡高，因此，应将该病列入肉用种鸡的免疫程序中。
（6）疫苗接种日龄与家禽易感性的关系：例如1～3日龄雏鸡对鸡马立克氏病的易感性最高，因此，必须在雏鸡出壳后24小时内完成鸡马立克氏病免疫接种。
（7）免疫途径：同一疫苗的不同途径，可以获得截然不同的免疫效果。例如：鸡新城疫低毒力活疫苗La Sota 弱毒株滴鼻或点眼所产生的免疫效果是饮水免疫的4倍以上，又如：鸡传染性法氏囊病活疫苗的毒株具有亲嗜肠道，在肠道内大量繁殖这一特性，因而其最佳免疫途径是滴口或饮水。又如：鸡痘活疫苗的免疫途径是刺种，而采用其它途径免疫时，效果极差甚至带来一定的副作用。
（8）同一种疫苗应根据其毒株毒力强弱不同，应先弱后强免疫接种，如对鸡传染性支气管炎的免疫，首免应选用毒力较弱的H120株，二免应选用毒力相对较强的H52株；对鸡传染性法氏囊病的免疫则采用先弱后中等毒力毒株。
（9）疫病发生与季节性关系：很多疫病的发生具有明显的季节性，如肾型传支多发于寒冷的冬季，因此冬季饲养的鸡群应选择含有肾型传支病毒弱毒株（Ma5株、28/86）的疫苗进行免疫。
（10）对于难以控制的传染病如鸡新城疫、鸡传染性支气管炎，应考虑使用活疫苗和灭活疫苗同时接种，取各自所长，才能有效控制疫病的发生。
（11）根据流行病学特点，有针对性的选用同一血清型或亚型的疫苗毒株。
（12）合理安排不同疫苗的接种时间，尽量避免不同疫苗毒株间的干扰。
（13）根据疫苗产品质量，确定合适的免疫剂量或疫苗稀释量。
（14）根据免疫监测结果及多发疾病流行特点，对免疫程序及时进行必要的修改和补充。
